Quantcast
Channel: Kommende arrangement ved UiB
Viewing all 9278 articles
Browse latest View live

Interactive Molecular Graphics: seeing and touching molecules in motion

$
0
0

Speaker: Marc Baaden

Abstract: Computational biology greatly benefits from approaches such as molecular dynamics simulations to study complex molecular assemblies. Interactive visualization and analysis of such systems is challenging and calls for new tools to aid hypothesis generation and exploration of large datasets. I will illustrate these issues using examples from our work on biological systems (ion channels & anesthesia, membrane fusion, flu virus, ..). To tackle such visualization challenges, we recently developed the HyperBalls representation implemented through ray-casting on Graphics Processing Units. The method was ported to the Unity3D game engine, developing the UnityMol framework as basis for further visualization experiments. A particular focus lies on interactive exploration and manipulation using tools such as haptic devices or very recently the LeapMotion controler.


Pål Sætrom: Transcription profiling during the cell cycle shows that a subset of Polycomb-targeted genes is upregulated during DNA replication

$
0
0

Dear all,

This Friday (April 26, 13:30) we will have an MBI/Sars/CBU seminar by Pål Sætrom from NTNU:

Title:

Transcription profiling during the cell cycle shows that a subset of Polycomb-targeted genes is upregulated during DNA replication

Abstract:
Genome-wide gene expression analyses of the human somatic cell cycle have indicated that the set of cycling genes differ between primary and cancer cells. By identifying genes that have cell cycle dependent expression in HaCaT human keratinocytes and comparing these with previously identified cell cycle genes, we have identified three distinct groups of cell cycle genes. First, housekeeping genes enriched for known cell cycle functions; second, cell type-specific genes enriched for HaCaT-specific functions; and third, Polycomb-regulated genes. These Polycomb-regulated genes are specifically upregulated during DNA replication, and consistent with being epigenetically silenced in other cell cycle phases, these genes have lower expression than other cell cycle genes. We also find similar patterns in foreskin fibroblasts, indicating that replication-dependent expression of Polycomb-silenced genes is a prevalent but unrecognized regulatory mechanism.

With best regards
Marc Rehmsmeier

Seminar over selvvalgt emne: Romvær - årsaker og konsekvenser

$
0
0

Ph.D – kandidat Mahdi Purmohammadi avholder seminar over selvvalgt emne:
”Space weather, cause and effects”

Komité: Kjellmar Oksavik og Thomas Gjesteland

Alle interesserte er velkommen.

Pansteatitis in African sharptooth catfish, Clarias gariepinus (Burchell), in the Kruger National Park, South Africa

Serendipity

Lunsjmøte om helsevitenskapenes samfunnsrolle

$
0
0

Førstkommende tirsdag 30.4 er det klart for vårens

siste lunsjmøte om fakultetenes samfunnsoppdrag.

Odontologibygget TIRSDAG 30. APRIL kl. 12.15

i rom MOLAR 1. Kort innledning ved professor

STEFAN HJØRLEIFSSON og påfølgende paneldebatt.

Møtet varer ca EN TIME og er ÅPENT FOR ALLE. Vi

serverer GRATIS KAFFE og RUNDSTYKKER

Informasjonsoppslag er vedlagt.

Mvh.
Magne Seierslund
seminargruppa

Mastereksamen: Kjetil Sørlien Nordanå

$
0
0

Det holdes avsluttende mastereksamen i Statistikk - Finansteori og forsikringsmatematikk for Kjetil Sørlien Nordanå torsdag 2. mai kl 12:30 i seminarrom 640.

 

Tittel på masteroppgaven er: SYNTETISK CDO: ITRAXX-PRISING VED BRUK AV EN NORMAL INVERS GAUSSISK COPULA

SENSOR: PROFESSOR SVEIN-ARNE PERSSON (NHH)
VEILEDER: FØRSTEAMANUENSIS BÅRD STØVE

Kandidaten vil kl. 12.30 gi en halvtimes presentasjon av sin mastergradsoppgave. Denne presentasjonen er offentlig. Veileder og sensor er til stede. Kl. 13.00 vil kandidaten bli eksaminert i oppgaven sin. Denne delen er ikke offentlig.

 

Disputas - Chirag Nepal

$
0
0

Ph.d kandidat ved institutt for informatikk, CHIRAG NEPAL disputerer fredag 3.mai for ph.d.-graden med avhandlingen:

”Regulatory mechanisms of non-coding RNAs during zebrafish embryogenesis


Evalueringskomiteen består av:

 

Opponent:

Professor Nicholas M. Luscombe

UCL Genetics Institute, Storbritannia

 

Opponent:

Principal Investigator, ph.d. Fiona C.Wardle

King’s College London, Storbritannia

 

Øvrig medlem i komiteen:

Professor, ph.d. Ingvar Eidhammer

Institutt for informatikk, Universitetet i Bergen

 

Leder av disputasen:

Professor Jon Vidar Helvik, Universitetet i Bergen

 

 

Adgang for interesserte tilhørere.
Velkommen til lokalet i god tid før disputasen!


Prøveforelesning Nkomba Kayeyi

$
0
0

Oppgitt emne:

How changes in sexual risk behaviour contributed to declining trends in HIV prevalence among young people in Zambia”.

Ny doktorgrad - Unges hiv-risiko henger sammen med nabolaget de bor i

$
0
0

Nkomba Kayeyi disputerer tirsdag 7. mai 2013 for ph.d.-graden ved Universitetet i Bergen med avhandlingen: “Trender i hiv-forekomst og seksualadferd blant unge mennesker i Zambia: geografiske og sosioøkonomiske ulikheter ”.

Universitetet i Bergens pressemelding.

Prøveforelesning - Heidi Kjennbakken

$
0
0

Ph.d.-kandidat Heidi Kjennbakken

vil holde følgende prøveforelesning over oppgitt emne for ph.d.-graden:

 

"Ocean dynamics and climate variability during the last interglacial period"

 

 

Komité for bedømmelse av prøveforelesningen:

1.aman. Helga F. Kleiven, GEO (leder)

Professor Atle Nesje, GEO

Professor Stein Erik Lauritzen, GEO

 

 

Adgang for interesserte tilhørere

VELKOMMEN! 

Doktor Proktor og museets skrekk.

$
0
0

Doktor Proktor er forskrekket! Han har på vårt museum funnet spor etter et hittil ukjent og potensielt farlig dyr for museer. Kan du hjelpe forskere og museumsfolk med å finne ut hvordan dette dyret ser ut og hvorfor det er farlig for museer? Sporjakt og verksted .

Gladnyhet for Proktor-tilhengerne og alle andre: Den populære utstillingen "Doktor Proktors sensasjonelle samling av Dyr Du Skulle Ønske Ikke Fantes" blir inntil videre stående på Universitetsmuseet også ut mai måned.

Passer for hele familien.

Doktor Proktor og museets skrekk

$
0
0

Doktor Proktor er forskrekket! Han har på vårt museum funnet spor etter et hittil ukjent og potensielt farlig dyr for museer. Kan du hjelpe forskere og museumsfolk med å finne ut hvordan dette dyret ser ut og hvorfor det er farlig for museer? Sporjakt og verksted .

Passer for hele familien.

Gladnyhet for Proktor-tilhengerne og alle andre: Den populære utstillingen "Doktor Proktors sensasjonelle samling av Dyr Du Skulle Ønske Ikke Fantes" blir inntil videre stående på Universitetsmuseet også ut mai måned.

Department of social anthropology seminar with Beth E. Notar

$
0
0

The Department of Social Anthropology has the pleasure to invite you to this week's  seminar with Dr Beth E. Notar from Trinity College, CT:

 

"'My Father is Li Gang!': Transgressive Mobility and Playful Corruption in Contemporary Urban China"

 

Abstract:

Conceptually, scholars have often linked mobility with freedom and with resistance to state power (e.g., Cresswell 1996, 2006). If the state is interested in control, in order and in discipline, then mobility has been described as a positive form of transgression against the state, against control, and against stasis. But what happens when transgressive mobility is done not by subalterns, not by the oppressed, but by those in power, or by those related to power through kinship connections, or by those who aspire to power? This paper examines three "sites" of transgressive mobility in contemporary urban China -- street crossing, hit-and-run accidents, and drag racing - to ask how we might reconceptualize the relationship between mobility and power.

 

Refreshments and further discussions in the department lunch room after the seminar.

 

All welcome!

 

Best regards,

BSAS Committee

Contested games: Brazil before the 2014 World Cup and the 2016 Olympics

$
0
0

In 2014 Brazil will host the FIFA World Cup, and in 2016 the city of Rio de Janeiro will host the Summer Olympic Games. The preparations for these mega-events directly affect tens of thousands of Brazilians.

The film Before The Party is a critical comment on how the preparations play out in the city of Rio de Janeiro. It takes us to several favelas, the self-constructed neighbourhoods in which some 22 percent of cariocas live. How do the preparations for the mega-events shape favela life, as well as the relations between poor and rich people? The film will be introduced by its director, senior researcher Einar Braathen (NIBR). 

After the screening, associate professor Gilmar Mascarenhas (State University of Rio de Janeiro) will share his perspectives about the current situation in Rio as the city gets ready for the World Cup and the Olympics. This will be followed by questions and discussion.

The film, presentations and discussion will be in English and Portuguese.

Film: Before the Party (2012, director: Einar Braathen, camera: Anne Kjersti Bjørn, editing: Helga Fjordholm; English and Portuguese, 14 min.).

Einar Braathen is Senior Researcher at the Norwegian Institute for Urban and Regional Research (NIBR). He is currently a coordinator of the project Urban Chances - City Growth and the Sustainability Challenge (Chance2Sustain) funded by the EU Commission, with special responsibilty for the research on Rio de Janeiro.

Gilmar Mascarenhas is Associate Professor at the Universidade do Estado do Rio de Janeiro (State University of Rio de Janeiro). Specialized in urban and sports geography, Mascarenhas has published several international articles and a book about the relations between sports mega-events and host cities with a focus on territorial changes, conflicts and citizenship.

The film seminar is hosted by the Everyday Maneuvers research project, Chr. Michelsen Institute.


Prøveforelesning - Yuangao Qu

$
0
0

Ph.d.-kandidat Yuangao Qu vil holde følgende prøveforelesning over oppgitt emne for ph.d.-graden:

 

"Onset and Evolution of Atmospheric Oxygen on the Early Earth"

 

Komité for bedømmelse av prøveforelesningen:

Forsker Nicola McLoughlin, GEO/CGB (leder)

Professor Ulysses Ninnemann, GEO

Post doktor Eugene Grosch, CGB

 

Velkommen!

Midtveisevaluering - Inger Marie Løes

$
0
0

Inger Marie Løes sin midtveisevaluering finner sted onsdag 08.05, klokken 14:30 i seminarrommet i 8 etasje, Laboratoriebygget.  Alle som ønsker å delta er velkommen.

Prosjektets tittel: "Genetisk heterogenitet i synkrone levermetastaser ved colorectalcancer"

Abstract: I moderne medikamentell kreftbehandling tilstreber man å skreddersy behandlingen for den enkelte pasient. Det er derfor et økende behov for kunnskap om de ulike kreftsykdommenes biologi.

For metastatisk colorectalcancer er det i dag ikke klart om genprofilen i primærtumor eller i en enkelt metastase er tilstrekkelig representativ for samtlige metastaser i samme pasient. Molekylærbiologiske forandringer i tumorvevet danner imidlertid allerede grunnlag for terapivalg. Dersom det viser seg at metastasene er heterogene vil det kunne ha direkte konsekvens for dagens pasientbehandling. Målsetningen for denne studien er å undersøke om levermetastaser fra colorectalcancer hos et individ har monoklonalt opphav. Dette vil bli vurdert ut fra genanalyser i et innsamlet biopsimateriale.

Materialet består av vev fra 164 pasienter som er operert for levermetastaser fra colorectalcancer i perioden fra 2006 frem til i dag. Omtrent halvparten av pasientene har fått kjemoterapi før operasjonen mens de øvrige er operert uten forutgående cellegiftbehandling.

Vi undersøker enkeltgener så vel som funksjonelle signalveger ved hjelp av mutasjonsscreening, genekspresjonsanalyser, epigenetiske analyser og proteinuttrykk. I tillegg gjør vi, gjennom samarbeid med Oslo universitetssykehus, globale kopitallsanalyser.

En undergruppe av pasientene har kun en singel metastase ved operasjon. Ved å sammenligne genprofilene fra denne gruppen med dem fra pasienter med multiple metastaser vil vi kunne forklare forskjeller i sykdomsprognose og legge grunnlag for differensiert og individualisert behandling. I tillegg vil sammenlikning av de biologiske forandringene i pasienter med og uten forutgående cellegiftbehandling kunne bidra til økt kunnskap om mekanismene for kjemoresistens.

 

Midtveisevaluering - Rita Vik

$
0
0

Rita Vik sin midtveisevaluering finner sted onsdag 08.05, klokken 13:00 i seminarrommet i 8 etasje, Laboratoriebygget.  Alle som ønsker å delta er velkommen.

Tittel: Effekt av bioaktive komponenter på mitokondriell funksjon og utvikling av aterosklerose

Bakgrunn: Forekomsten av livsstilsykdommer som følge av overvekt øker stadig, og hjerte-karsykdommer er den vanligste årsaken til død i den Vestlige verden. Utviklingen av aterosklerose er nå knytt til inflammasjon og mitokondriell dysfunksjon.

Hensikten med prosjektet er å se på effekten av protein fra laks og kylling i tillegg til en modifisert fettsyre analog, TTA og hvordan disse påvirker utvikling av aterosklerose i en musemodell disponert for aterosklerose.

Metode: ApoE knockout mus blir brukt til å studere effekten av proteinkildene og TTA. Blodprøver blir tatt underveis. og etter en fóringsperiode på 12 uker, blir dyrene avlivet. Deretter blir det gjort målinger på fett metabolisme i lever, kolesterol og fettsyresammensetning i blodet og estimering av aterosklerotisk plakk i aorta.

Resultat: Diettene med lakseprotein og TTA viser til mindre plakkutvikling hos ApoE knockout musene. I tillegg øker fettsyreoksidasjonen i mitokondria etter TTA fóring. Så langt, viser kyllingproteinet til redusert kolesterol nivå i blodet, samt økt mitokondriell funksjon.

Forløpig konklusjon er at protein fra laks og kylling, og fettsyren TTA reduserer utvilking av aterosklerose i ApoE knockout mus. Hvorvidt aterosklerotisk plakk i aorta er redusert i gruppen som har fått kyllingprotein, gjenstår å analysere.

 

Crisis and austerity: A painful watershed for the South European welfare state

$
0
0

Open lecture with Professor Maria Petmesidou: What is the status and impact of the financial crisis on the welfare states in Greece and other countries in South Europe?

Over the last decades welfare states in South Europe have had major gaps in social protection despite increasing social expenditure, including persistently low redistributive effects of social transfers and comparatively high poverty rates. Social vulnerability has increased further due to the impact of the current financial crisis. Can this crisis provide a spur to improving institutional capabilities in social welfare, or is it dealing a serious blow to the (albeit weak) South European welfare states?

Professor Petmesidouwill propose an in-depth analysis of the Greek case, including the "conditionalities" of the "rescue-deals" agreed between the so-called "troika" (IMF-EU-ECB) and the Greek government, and the ensuing sweeping reforms dismantling social welfare and labour protection. The analysis will include comparisons with Spain and Portugal, with an emphasis on deepening social polarization, heightened insecurity among large sections of the population and increasing poverty.

Maria Petmesidou is professor of Social Policy at the Democritus University of Thrace, Greece. She is a CROP Research Fellow and a University of Bergen SPIRE guest researcher.

Disputas - Dominik H. Lang

$
0
0

Ph.d. Dominik H. Lang disputerer for dr.philos.-graden ved Universitetet i Bergen med avhandlingen:

“Earthquake Damage and Loss Assessment –

Predicting the Unpredictable”

 

 

Bedømmelseskomitéen:

Opponent:

Professor, ph.d. John Douglas

Bureau de Recherches Géologiques et Minières, Frankrike

 

Opponent:

Professor, ph.d. Mario Gustavo Ordaz Schroeder

Instituto de Ingeniería, Universidad Nacional Autónoma de México

 

Øvrig medlem i komiteen:

Professor, ph.d. Stéphane Rondenay

Institutt for geovitenskap, Universitetet i Bergen

 

Leder av disputasen:

Professor Ritske Huismans, Universitetet i Bergen

 

 

 

Adgang for interesserte tilhørere.

Velkommen til lokalet i god tid før disputasen!

Viewing all 9278 articles
Browse latest View live